Données scientifiques

Au croisement de la génomique, du phénotypage végétal et de la bio-informatique, Cyril Pommier a construit une démarche de recherche profondément ancrée dans les principes de la science ouverte. À travers sa thèse, récemment soutenue, il interroge la manière dont les standards, les bonnes pratiques et les principes FAIR peuvent transformer durablement la production, le partage et la réutilisation des données de phénotypage végétal. Dans cet entretien, il revient sur les raisons qui l’ont conduit à formaliser ses travaux dans une thèse en VAE, et partage son regard sur les enjeux, les freins et les défis à venir pour la science ouverte.

Qu'elles concernent les recherches dans les domaines de l'agriculture, l'alimentation ou l'environnement, toutes les disciplines scientifiques étudiées à INRAE sont désormais réunies dans un référentiel ouvert et accessible à toutes et tous.

La cinquième édition du « Printemps de la donnée » se déroulera du 24 mars au 25 juin 2025. Cette nouvelle édition vise à poursuivre la mise en avant des diverses initiatives locales autour de la production, du partage et de la réutilisation de données FAIR dans un contexte de science ouverte. Un recensement de vos actions (évènements, retours d’expériences croisés, cas d’usages…) est d’ores et déjà possible sur le site dédié printempsdeladonnee.fr, quels que soient les publics.

En complément de l’accompagnement INRAE pour l'obtention de ressources numériques dans le cadre d'un projet de recherche, l’European Open Science Cloud (EOSC) propose 6 services accessibles aux personnels scientifiques et d’appui en Europe pour gérer leurs données de recherche.

Le Printemps de la donnée est l’occasion d’initier ou de participer à des actions de complétude et d’amélioration de la qualité des métadonnées descriptives des jeux de données et de la documentation associée. Cette phase du cycle de vie de la donnée, appelée curation, œuvre à rendre les données conformes aux principes FAIR.

Initié par INRAE dans une démarche de science ouverte impliquant des acteurs de la société civile, le réseau Centipede-RTK est une solution peu coûteuse et fiable de géolocalisation au centimètre près, nécessaire aux activités agricoles de précision. Retour sur ce réseau ouvert et collaboratif qui ne cesse de se développer, en France et dans le monde.

La quatrième édition du « Printemps de la donnée » se déroulera du 20 mars au 24 juin 2025. Cette nouvelle édition vise à poursuivre la mise en avant des diverses initiatives locales autour de la production, du partage et de la réutilisation de données FAIR dans un contexte de science ouverte. Un recensement de vos actions (évènements, retours d’expériences croisés, cas d’usages…) est d’ores et déjà possible sur le site dédié printempsdeladonnee.fr, quels que soient les publics.

Vous ne connaissez pas encore le thésaurus INRAE ? Découvrez dans un article récent de la revue NOV'AE cet outil essentiel pour améliorer l’indexation, la recherche documentaire et la valorisation des productions scientifiques de l'Institut, et partagez des témoignages de chercheurs qui l’utilisent au quotidien pour faciliter leurs travaux et promouvoir une science plus ouverte et accessible.

Le 26 novembre 2024, les projets MAKAHO et Cartographie nationale des milieux humides, dans lesquels sont impliqués des équipes INRAE ont été récompensés par le ministère de l'Enseignement supérieur et de la Recherche à l'occasion de la remise des prix Science ouverte des données 2024, une initiative pour valoriser les projets et chercheurs contribuant activement à la gestion, la diffusion et la réutilisation des données.

Dans un contexte d’accélération et d’ouverture de la recherche, la gestion des données devient un enjeu capital notamment de par leur volume, hétérogénéité et valeur. Du 1ᵉʳ au 4 octobre 2024, les 29 participants à la première école thématique FairData@INRAE ont pu aborder les fondamentaux de l’Open Data, les plans de gestion de données, la sécurisation des données, les standards de métadonnées, les entrepôts de données, le cadre juridique du partage des données et enfin la valorisation des données de la recherche.

Le data paper est une publication scientifique qui décrit un ou plusieurs jeux de données, leurs méthodes d’obtention et leurs potentiels pour de
futures recherches. Les pratiques de rédaction et de dépôt de ce nouveau type d’article sont peu connues. Une enquête menée en 2023 auprès de la communauté scientifique française a permis de recueillir les pratiques des scientifiques en matière de publication de data paper. Le rapport d'analyse des réponses à l'enquête est disponible depuis HAL INRAE.

Une nouvelle version de l'affiche "Cycle de vie des données : un outil pour améliorer la gestion, la mise en qualité et l'ouverture des données" est parue. Elle prend en compte les évolutions de l'écosystème open data.