LINDA, outil de gestion des métadonnées de phénotypage des plantes
L’application web Linda, propose un outil complet de saisie et gestion des métadonnées associées à une expérimentation de phénotypage sur les plantes. Elle permet ainsi de décrire de façon intuitive les informations telles que le design expérimental, les protocoles de croissance, les mesures environnementales etc. Linda est couplée avec une base de données qui stocke ces informations de façon pérenne. Cette base de données utilise les ontologies de référence (e.g., Plant Ontology, Crop Ontology, etc.) et des normes dédiées à ce type d’expériences telles que la norme Minimal Information About Plant Phenotyping Experiment (MIAPPE). Le partage de données est facilité d’une part par le respect des principes FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable) ainsi que par la possibilité d’exporter ces métadonnées relatives à l’expérimentation dans les formats tabulés ou alors formatés pour la soumission dans les bases de données internationales (ISA-tab).
Intervenant : Benjamin Dartigues (CNRS - Bordeaux)
Consulter les supports :